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我國首次發布海洋化合物數據庫

日期:2018-07-04 14:38    作者:    來源:科技日報     打印    加大 減小

科技日報青島7月3日電 (記者王建高 通訊員王寧 高倩)3日,在青島舉行的“2018年全球海洋院所領導人會議”上,青島海洋科學與技術試點國家實驗室學術委員會主任、中國工程院院士管華詩發布了海洋試點國家實驗室海洋天然產物三維結構數據庫。這是我國首次正式發布海洋化合物數據庫。

管華詩表示,海洋是一個巨大的藥源寶庫,迄今為止,人們已經發現了約3萬個結構新穎、活性多樣的海洋天然產物。海洋試點國家實驗室、青島海洋生物醫藥研究院及中國海洋大學等多個單位聯合開發了首個針對海洋天然產物的三維結構數據庫,該數據庫含有約31000個海洋天然產物的準確三維結構,可直接用于虛擬篩選與智能藥物設計,提升海洋藥物開發速度與效率。

海洋試點國家實驗室構建了全球首個包含3萬余個人類已知的海洋化合物的3D數據庫、首次完成170余個美國FDA批準的腫瘤藥物靶點對海洋化合物數據庫的精確篩選,發現1000余個具有開發前景的抗腫瘤藥物苗頭分子,經過生物學、藥理藥效學分析,海洋藥物篩選準確率由20%以下躍升到70%以上。

海洋試點國家實驗室創立的“智能超算耦合生物實測”的創新海洋藥物篩選體系實現了“快速篩選、高效驗證和準確尋靶”的目標,該系統不再依賴于大量的海洋化合物實體,而是利用計算機仿真,將知識層面的海洋化合物轉化為虛擬分子數據,并用于藥物篩選,解決了創新海洋藥物開發的“化合物獲取困難”這一最大瓶頸問題。這是世界上首次利用超級計算機技術、生物技術和藥物設計的積累,系統性地對已有的蛋白靶點和所有的化合物進行成藥性潛力評估,這一體系的建成將極大地推動我國藥物開發事業的發展。

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