在低碳經濟的大環境下，海水養殖的生態安全越來越受到人們關注。“我們正在實施的多營養層次生態養殖模式與技術，是根據養殖海域的容納量，把不同營養級的種類組合到一起。比如，養魚要投飼料，而貝類是濾食性動物，以海水中的浮游生物為食，藻類則是吸收海水中的碳、氮、磷等物質。”黃海水產研究所的研究員方建光表示，“這就是一種全新的低碳養殖新模式”。

為了通俗地闡述這一模式，方建光進一步解釋：“就魚類、貝類和藻類的組合養殖而言，魚類所排出的二氧化碳、氮、磷等物質，由大型藻類和浮游植物來吸收；浮游植物和魚類吃剩的微小顆粒物質，成為貝類的餌料；而大型顆粒物質沉到海底后，可以為海參等腐食性生物提供食物，通過這套系統，可以把水產養殖對生態系統的危害降到最低。不能說這種生態養殖模式與技術一點害處沒有，但比起原有單一品種的養殖來說，危害性會大大降低。”

說到單一品種養殖對生態的破壞，方建光說：“以養魚蝦為例，飼料中所含的營養物質，大約只有50%能被魚蝦吸收，其他則沉積到海底，再加上魚蝦的排泄物，也會沉淀到海底。”“在南方一些網箱養殖的老海區，長達幾十年的養魚歷史，導致這些地區的海底聚集了大量沉積物，形成了一個缺氧的環境，造成海底生物滅絕。從總體上來看，魚、蝦、蟹、貝等水生動物養殖對水域污染的污染物主要來自殘餌、消毒藥品、排泄物等，特別是殘餌產生的氮、磷等物質是導致養殖水域富營養化的元兇之一。富營養化的水質不僅是病原滋生的前提條件，甚至可能會誘發赤潮，會給海水養殖帶來災難性后果。

因此，要想實現海水養殖的生態化，保護海洋生態環境，就必須大力推廣低碳養殖，具體說就是大量采用低碳與移碳技術。主要是指在生態養殖中加入藻類和濾食性貝類。

“目前來看，多營養層次的生態養殖模式與技術的推廣主要集中在北方，包括山東的榮成，以及東北地區的大連等，青島地區推廣這種養殖模式的基礎條件很好，但需要規模化、集約化的企業參與和政府的引導。”方建光認為，“雖然這種養殖方式在技術層面上已經成熟，但在我國南方，由于大多是農戶式的養殖方式，還沒有大范圍推廣。這種養殖方式從效益上肯定要高于單一品種的養殖，但要讓養殖戶看到利益，還需要政府部門的引導與扶持。”