日前,植物學知名期刊Frontiers in Plant Science在線發表了黃海水產研究所藻類種質資源與功能團隊題為“Identification of Genes under Positive Selection Reveals Differences in Evolutionary Adaptation between Brown-Algal Species”的最新研究成果。該團隊與英國東安格利亞大學的Thomas Mock教授開展了合作研究,通過全基因組水平正選擇基因的鑒定與分析,發現了海帶與水云在適應性進化歷程中起到關鍵作用的基因,從正選擇角度揭示了大型褐藻的形成與進化機制。黃海所博士后滕林宏為該論文的第一作者。
該研究以褐藻中的模式物種水云和有參考基因組的海帶為研究對象,采用雙向最佳比對明確了同源基因;根據編碼基因密碼子中同義替換與非同義替換的比率,鑒定出水云和海帶中分別受到正選擇壓力作用的基因;通過對目標基因進行功能注釋和分類,明確了其參與的生物學過程;結合組學數據分析,解析了各種環境條件下及不同世代藻體中正選擇基因的作用機制。研究結果為全面揭示褐藻的進化歷程和適應機制提供了理論依據和數據支持。
該研究得到了現代農業產業技術體系崗位專家、青島海洋科學與技術國家實驗室“鰲山人才”優秀青年學者、山東省杰出青年科學基金和青島市創業領軍人才計劃等項目的資助。

海帶正選擇基因在不同世代中的表達水平