孔杰，男， 1963年5月生，山東高密人，副所長，研究室主任，研究員二級，博士生導師。1983年山東海洋學院（現為中國海洋大學）本科畢業，1986年山東海洋學院（現中國海洋大學）碩士畢業，研究生學歷，博士學位。

1986在黃海水產研究所參加工作。1993年任種質資源與工程育種研究室副主任，2002年任研究室主任，2011年任所長助理，2013年4月起任副所長。1993年晉升副研究員，2000年晉升研究員。主要兼職包括中國水產科學研究院水產遺傳育種領域首席科學家、水產育種研究中心技術領域責任專家、第四屆全國原種和良種審定委員會委員、海洋湖沼學會甲殼類分會理事、農業部（國家）水產種質與漁業環境質量監督檢驗測試中心（青島）副主任、中國科學院海洋研究所和中國海洋大學博士生導師以及中國海洋大學、上海水產大學、大連水產大學和南京農業大學碩士生導師。獲新世紀百千萬人才工程國家級人選、享受政府特殊津貼人員、山東省和農業部有突出貢獻中青年專家、青島市專業技術拔尖人才等多項榮譽稱號。

主要研究領域包括：水產動物多性狀復合育種理論體系的引進與開發，重要海水養殖動物分子標記輔助育種研究以及重要海水養殖動物的養殖生物學研究。近五年先后主持國家863計劃“鲆鰈類高產、抗逆品種的培育”、“基于全基因組信息的對蝦遺傳選育”課題、國家自然科學基金項目“中國對蝦”“黃海2號”“對WSSV抗性的遺傳決定分析”、山東省“兩區”建設專項資金項目“對蝦良種生產、擴繁技術集成與示范平臺”等十余項國家級、省部級課題，在水產動物遺傳育種方面做出突出成績。建立了具有廣泛推廣價值的“水產動物多性狀復合育種技術”體系，并成功應用于中國對蝦、大菱鲆等8個物種的品種選育中，培育出中國對蝦“黃海2號”新品種和大菱鲆“丹法鲆”新品種，開發了3套水產動物育種分析與管理軟件，獲授權國家發明專利8項，發表學術論文170余篇，培養博士生6人，碩士生25名，國家和省部、市級獎勵13項。